Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxd3Q61060 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd3Q61060 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd3Q61060 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxd3Q61060 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxd3Q61060 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd3Q61060 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd3Q61060 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd3Q61060 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxd3Q61060 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd3Q61060 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd3Q61060 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Foxd3Q61060 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd3Q61060 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd3Q61060 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd3Q61060 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd3Q61060 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd3Q61060 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd3Q61060 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd3Q61060 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd3Q61060 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms