Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Caprin1Q60865 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caprin1Q60865 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Caprin1Q60865 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Caprin1Q60865 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Caprin1Q60865 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Caprin1Q60865 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Caprin1Q60865 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Caprin1Q60865 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Caprin1Q60865 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Caprin1Q60865 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Caprin1Q60865 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Caprin1Q60865 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Caprin1Q60865 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Caprin1Q60865 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Caprin1Q60865 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Caprin1Q60865 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Caprin1Q60865 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Caprin1Q60865 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Caprin1Q60865 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Caprin1Q60865 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Caprin1Q60865 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Caprin1Q60865 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Caprin1Q60865 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Caprin1Q60865 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Caprin1Q60865 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Caprin1Q60865 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Caprin1Q60865 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Caprin1Q60865 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Caprin1Q60865 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Caprin1Q60865 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Caprin1Q60865 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Caprin1Q60865 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Caprin1Q60865 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Caprin1Q60865 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Caprin1Q60865 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Caprin1Q60865 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Caprin1Q60865 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Caprin1Q60865 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Caprin1Q60865 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Caprin1Q60865 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin1Q60865 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin1Q60865 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Caprin1Q60865 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms