Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd4Q60688 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Foxd4Q60688 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Foxd4Q60688 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Foxd4Q60688 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Foxd4Q60688 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Foxd4Q60688 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Foxd4Q60688 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Foxd4Q60688 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Foxd4Q60688 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Foxd4Q60688 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Foxd4Q60688 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Foxd4Q60688 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Foxd4Q60688 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Foxd4Q60688 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Foxd4Q60688 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Foxd4Q60688 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxd4Q60688 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxd4Q60688 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Foxd4Q60688 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Foxd4Q60688 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Foxd4Q60688 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxd4Q60688 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxd4Q60688 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxd4Q60688 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxd4Q60688 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Foxd4Q60688 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxd4Q60688 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxd4Q60688 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxd4Q60688 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd4Q60688 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd4Q60688 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxd4Q60688 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxd4Q60688 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxd4Q60688 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd4Q60688 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms