Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2aQ60648 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm2aQ60648 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2aQ60648 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2aQ60648 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2aQ60648 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2aQ60648 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2aQ60648 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2aQ60648 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm2aQ60648 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm2aQ60648 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2aQ60648 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2aQ60648 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2aQ60648 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2aQ60648 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2aQ60648 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2aQ60648 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2aQ60648 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2aQ60648 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2aQ60648 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2aQ60648 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2aQ60648 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2aQ60648 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2aQ60648 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2aQ60648 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2aQ60648 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2aQ60648 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2aQ60648 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2aQ60648 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2aQ60648 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms