Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp20Q5XG71 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp20Q5XG71 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp20Q5XG71 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp20Q5XG71 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp20Q5XG71 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp20Q5XG71 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp20Q5XG71 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp20Q5XG71 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp20Q5XG71 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp20Q5XG71 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp20Q5XG71 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp20Q5XG71 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp20Q5XG71 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp20Q5XG71 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp20Q5XG71 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp20Q5XG71 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp20Q5XG71 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp20Q5XG71 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Utp20Q5XG71 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Utp20Q5XG71 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp20Q5XG71 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp20Q5XG71 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp20Q5XG71 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp20Q5XG71 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms