Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp13a4Q5XF90 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp13a4Q5XF90 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp13a4Q5XF90 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp13a4Q5XF90 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp13a4Q5XF90 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp13a4Q5XF90 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp13a4Q5XF90 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp13a4Q5XF90 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp13a4Q5XF90 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp13a4Q5XF90 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp13a4Q5XF90 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp13a4Q5XF90 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp13a4Q5XF90 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Atp13a4Q5XF90 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp13a4Q5XF90 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atp13a4Q5XF90 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atp13a4Q5XF90 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp13a4Q5XF90 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp13a4Q5XF90 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp13a4Q5XF90 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp13a4Q5XF90 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp13a4Q5XF90 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp13a4Q5XF90 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp13a4Q5XF90 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp13a4Q5XF90 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp13a4Q5XF90 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp13a4Q5XF90 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp13a4Q5XF90 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp13a4Q5XF90 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp13a4Q5XF90 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp13a4Q5XF90 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp13a4Q5XF90 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp13a4Q5XF90 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp13a4Q5XF90 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp13a4Q5XF90 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp13a4Q5XF90 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp13a4Q5XF90 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp13a4Q5XF90 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp13a4Q5XF90 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp13a4Q5XF90 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp13a4Q5XF90 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp13a4Q5XF90 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp13a4Q5XF90 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp13a4Q5XF90 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atp13a4Q5XF90 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp13a4Q5XF90 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp13a4Q5XF90 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp13a4Q5XF90 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp13a4Q5XF90 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp13a4Q5XF90 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp13a4Q5XF90 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp13a4Q5XF90 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp13a4Q5XF90 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp13a4Q5XF90 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp13a4Q5XF90 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp13a4Q5XF90 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp13a4Q5XF90 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp13a4Q5XF90 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms