Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT7

Nkapl, NKAP-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkaplQ5SZT7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NkaplQ5SZT7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NkaplQ5SZT7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NkaplQ5SZT7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NkaplQ5SZT7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NkaplQ5SZT7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NkaplQ5SZT7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NkaplQ5SZT7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NkaplQ5SZT7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NkaplQ5SZT7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NkaplQ5SZT7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NkaplQ5SZT7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NkaplQ5SZT7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NkaplQ5SZT7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NkaplQ5SZT7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NkaplQ5SZT7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NkaplQ5SZT7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NkaplQ5SZT7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NkaplQ5SZT7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NkaplQ5SZT7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NkaplQ5SZT7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NkaplQ5SZT7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NkaplQ5SZT7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NkaplQ5SZT7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NkaplQ5SZT7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NkaplQ5SZT7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NkaplQ5SZT7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NkaplQ5SZT7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NkaplQ5SZT7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NkaplQ5SZT7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NkaplQ5SZT7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NkaplQ5SZT7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NkaplQ5SZT7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
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