Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYL3

Kiaa0100, Protein KIAA0100, mousemouse

Predictions only

Length 2,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa0100Q5SYL3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kiaa0100Q5SYL3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kiaa0100Q5SYL3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kiaa0100Q5SYL3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kiaa0100Q5SYL3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kiaa0100Q5SYL3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kiaa0100Q5SYL3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kiaa0100Q5SYL3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Kiaa0100Q5SYL3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kiaa0100Q5SYL3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kiaa0100Q5SYL3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kiaa0100Q5SYL3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kiaa0100Q5SYL3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Kiaa0100Q5SYL3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kiaa0100Q5SYL3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kiaa0100Q5SYL3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kiaa0100Q5SYL3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kiaa0100Q5SYL3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kiaa0100Q5SYL3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kiaa0100Q5SYL3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kiaa0100Q5SYL3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kiaa0100Q5SYL3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kiaa0100Q5SYL3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Kiaa0100Q5SYL3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kiaa0100Q5SYL3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kiaa0100Q5SYL3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kiaa0100Q5SYL3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kiaa0100Q5SYL3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kiaa0100Q5SYL3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kiaa0100Q5SYL3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kiaa0100Q5SYL3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kiaa0100Q5SYL3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kiaa0100Q5SYL3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kiaa0100Q5SYL3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kiaa0100Q5SYL3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kiaa0100Q5SYL3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kiaa0100Q5SYL3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kiaa0100Q5SYL3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kiaa0100Q5SYL3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kiaa0100Q5SYL3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kiaa0100Q5SYL3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kiaa0100Q5SYL3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kiaa0100Q5SYL3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Kiaa0100Q5SYL3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kiaa0100Q5SYL3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kiaa0100Q5SYL3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Kiaa0100Q5SYL3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kiaa0100Q5SYL3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kiaa0100Q5SYL3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kiaa0100Q5SYL3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kiaa0100Q5SYL3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kiaa0100Q5SYL3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kiaa0100Q5SYL3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms