Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mks1Q5SW45 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mks1Q5SW45 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mks1Q5SW45 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mks1Q5SW45 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mks1Q5SW45 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mks1Q5SW45 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mks1Q5SW45 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mks1Q5SW45 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mks1Q5SW45 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mks1Q5SW45 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mks1Q5SW45 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mks1Q5SW45 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mks1Q5SW45 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mks1Q5SW45 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mks1Q5SW45 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mks1Q5SW45 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mks1Q5SW45 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mks1Q5SW45 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mks1Q5SW45 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mks1Q5SW45 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mks1Q5SW45 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mks1Q5SW45 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mks1Q5SW45 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mks1Q5SW45 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mks1Q5SW45 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mks1Q5SW45 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mks1Q5SW45 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mks1Q5SW45 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mks1Q5SW45 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mks1Q5SW45 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mks1Q5SW45 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mks1Q5SW45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mks1Q5SW45 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mks1Q5SW45 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mks1Q5SW45 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mks1Q5SW45 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms