Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD0

Rflnb, Refilin-B, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RflnbQ5SVD0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RflnbQ5SVD0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RflnbQ5SVD0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RflnbQ5SVD0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RflnbQ5SVD0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RflnbQ5SVD0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RflnbQ5SVD0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RflnbQ5SVD0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RflnbQ5SVD0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RflnbQ5SVD0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RflnbQ5SVD0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RflnbQ5SVD0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RflnbQ5SVD0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RflnbQ5SVD0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RflnbQ5SVD0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RflnbQ5SVD0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RflnbQ5SVD0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RflnbQ5SVD0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RflnbQ5SVD0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RflnbQ5SVD0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RflnbQ5SVD0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RflnbQ5SVD0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RflnbQ5SVD0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RflnbQ5SVD0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RflnbQ5SVD0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RflnbQ5SVD0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RflnbQ5SVD0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RflnbQ5SVD0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RflnbQ5SVD0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RflnbQ5SVD0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RflnbQ5SVD0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms