Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc44a5Q5RJI2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a5Q5RJI2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a5Q5RJI2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a5Q5RJI2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a5Q5RJI2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a5Q5RJI2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a5Q5RJI2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a5Q5RJI2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a5Q5RJI2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a5Q5RJI2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc44a5Q5RJI2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc44a5Q5RJI2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a5Q5RJI2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc44a5Q5RJI2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a5Q5RJI2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a5Q5RJI2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a5Q5RJI2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a5Q5RJI2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a5Q5RJI2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a5Q5RJI2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a5Q5RJI2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a5Q5RJI2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms