Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlha9Q5RJB0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bhlha9Q5RJB0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bhlha9Q5RJB0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bhlha9Q5RJB0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bhlha9Q5RJB0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Bhlha9Q5RJB0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bhlha9Q5RJB0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bhlha9Q5RJB0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bhlha9Q5RJB0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlha9Q5RJB0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bhlha9Q5RJB0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bhlha9Q5RJB0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlha9Q5RJB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Bhlha9Q5RJB0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bhlha9Q5RJB0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bhlha9Q5RJB0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlha9Q5RJB0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlha9Q5RJB0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlha9Q5RJB0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bhlha9Q5RJB0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlha9Q5RJB0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bhlha9Q5RJB0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms