Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZK1

Cep44, Centrosomal protein of 44 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep44Q5HZK1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep44Q5HZK1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep44Q5HZK1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep44Q5HZK1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep44Q5HZK1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep44Q5HZK1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep44Q5HZK1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep44Q5HZK1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep44Q5HZK1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep44Q5HZK1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep44Q5HZK1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep44Q5HZK1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep44Q5HZK1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep44Q5HZK1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep44Q5HZK1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep44Q5HZK1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep44Q5HZK1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep44Q5HZK1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep44Q5HZK1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep44Q5HZK1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep44Q5HZK1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep44Q5HZK1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep44Q5HZK1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep44Q5HZK1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep44Q5HZK1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep44Q5HZK1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep44Q5HZK1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep44Q5HZK1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep44Q5HZK1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms