Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkaa1Q5EG47 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkaa1Q5EG47 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkaa1Q5EG47 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkaa1Q5EG47 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkaa1Q5EG47 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkaa1Q5EG47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkaa1Q5EG47 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkaa1Q5EG47 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkaa1Q5EG47 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkaa1Q5EG47 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkaa1Q5EG47 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkaa1Q5EG47 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkaa1Q5EG47 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkaa1Q5EG47 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkaa1Q5EG47 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkaa1Q5EG47 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkaa1Q5EG47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkaa1Q5EG47 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkaa1Q5EG47 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkaa1Q5EG47 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms