Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Urb1Q571H0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb1Q571H0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb1Q571H0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Urb1Q571H0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Urb1Q571H0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb1Q571H0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb1Q571H0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb1Q571H0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb1Q571H0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb1Q571H0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb1Q571H0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb1Q571H0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb1Q571H0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb1Q571H0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Urb1Q571H0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb1Q571H0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb1Q571H0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb1Q571H0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb1Q571H0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb1Q571H0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb1Q571H0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb1Q571H0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Urb1Q571H0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb1Q571H0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Urb1Q571H0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb1Q571H0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb1Q571H0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb1Q571H0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb1Q571H0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb1Q571H0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb1Q571H0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb1Q571H0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb1Q571H0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Urb1Q571H0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb1Q571H0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb1Q571H0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb1Q571H0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb1Q571H0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Urb1Q571H0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Urb1Q571H0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb1Q571H0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Urb1Q571H0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb1Q571H0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb1Q571H0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb1Q571H0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb1Q571H0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb1Q571H0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb1Q571H0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb1Q571H0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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