Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prune2Q52KR3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prune2Q52KR3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prune2Q52KR3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prune2Q52KR3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prune2Q52KR3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune2Q52KR3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune2Q52KR3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prune2Q52KR3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prune2Q52KR3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune2Q52KR3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune2Q52KR3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prune2Q52KR3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prune2Q52KR3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prune2Q52KR3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prune2Q52KR3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune2Q52KR3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prune2Q52KR3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune2Q52KR3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prune2Q52KR3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prune2Q52KR3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prune2Q52KR3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prune2Q52KR3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prune2Q52KR3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prune2Q52KR3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prune2Q52KR3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prune2Q52KR3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune2Q52KR3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prune2Q52KR3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prune2Q52KR3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prune2Q52KR3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prune2Q52KR3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune2Q52KR3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune2Q52KR3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune2Q52KR3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune2Q52KR3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune2Q52KR3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prune2Q52KR3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune2Q52KR3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prune2Q52KR3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prune2Q52KR3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms