Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a5Q4LDG0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc27a5Q4LDG0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc27a5Q4LDG0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc27a5Q4LDG0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc27a5Q4LDG0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc27a5Q4LDG0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc27a5Q4LDG0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc27a5Q4LDG0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc27a5Q4LDG0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a5Q4LDG0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a5Q4LDG0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a5Q4LDG0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc27a5Q4LDG0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc27a5Q4LDG0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc27a5Q4LDG0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc27a5Q4LDG0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc27a5Q4LDG0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc27a5Q4LDG0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc27a5Q4LDG0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc27a5Q4LDG0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a5Q4LDG0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms