Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx25Q3ZT31 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx25Q3ZT31 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx25Q3ZT31 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Snx25Q3ZT31 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Snx25Q3ZT31 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snx25Q3ZT31 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx25Q3ZT31 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx25Q3ZT31 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx25Q3ZT31 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx25Q3ZT31 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx25Q3ZT31 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx25Q3ZT31 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx25Q3ZT31 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx25Q3ZT31 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx25Q3ZT31 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx25Q3ZT31 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx25Q3ZT31 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx25Q3ZT31 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx25Q3ZT31 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx25Q3ZT31 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx25Q3ZT31 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx25Q3ZT31 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx25Q3ZT31 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx25Q3ZT31 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx25Q3ZT31 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snx25Q3ZT31 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx25Q3ZT31 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx25Q3ZT31 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Snx25Q3ZT31 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx25Q3ZT31 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx25Q3ZT31 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx25Q3ZT31 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx25Q3ZT31 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx25Q3ZT31 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx25Q3ZT31 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx25Q3ZT31 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx25Q3ZT31 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx25Q3ZT31 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx25Q3ZT31 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx25Q3ZT31 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx25Q3ZT31 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx25Q3ZT31 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx25Q3ZT31 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Snx25Q3ZT31 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snx25Q3ZT31 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snx25Q3ZT31 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx25Q3ZT31 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx25Q3ZT31 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms