Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacs2Q3V3Q7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pacs2Q3V3Q7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pacs2Q3V3Q7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pacs2Q3V3Q7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pacs2Q3V3Q7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacs2Q3V3Q7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacs2Q3V3Q7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pacs2Q3V3Q7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pacs2Q3V3Q7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pacs2Q3V3Q7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacs2Q3V3Q7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacs2Q3V3Q7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pacs2Q3V3Q7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pacs2Q3V3Q7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pacs2Q3V3Q7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pacs2Q3V3Q7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pacs2Q3V3Q7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pacs2Q3V3Q7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pacs2Q3V3Q7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacs2Q3V3Q7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacs2Q3V3Q7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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