Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm906Q3V0M1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm906Q3V0M1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm906Q3V0M1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm906Q3V0M1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm906Q3V0M1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm906Q3V0M1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm906Q3V0M1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm906Q3V0M1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm906Q3V0M1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm906Q3V0M1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm906Q3V0M1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm906Q3V0M1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms