Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ57

Axdnd1, Axonemal dynein light chain domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Axdnd1Q3UZ57 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Axdnd1Q3UZ57 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Axdnd1Q3UZ57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Axdnd1Q3UZ57 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Axdnd1Q3UZ57 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Axdnd1Q3UZ57 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Axdnd1Q3UZ57 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Axdnd1Q3UZ57 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Axdnd1Q3UZ57 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Axdnd1Q3UZ57 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Axdnd1Q3UZ57 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Axdnd1Q3UZ57 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Axdnd1Q3UZ57 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Axdnd1Q3UZ57 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Axdnd1Q3UZ57 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Axdnd1Q3UZ57 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Axdnd1Q3UZ57 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Axdnd1Q3UZ57 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Axdnd1Q3UZ57 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Axdnd1Q3UZ57 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Axdnd1Q3UZ57 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Axdnd1Q3UZ57 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Axdnd1Q3UZ57 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Axdnd1Q3UZ57 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Axdnd1Q3UZ57 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Axdnd1Q3UZ57 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms