Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ09

C1rl, Complement C1r subcomponent-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rlQ3UZ09 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1rlQ3UZ09 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1rlQ3UZ09 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1rlQ3UZ09 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1rlQ3UZ09 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1rlQ3UZ09 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1rlQ3UZ09 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1rlQ3UZ09 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1rlQ3UZ09 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1rlQ3UZ09 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1rlQ3UZ09 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1rlQ3UZ09 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1rlQ3UZ09 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1rlQ3UZ09 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1rlQ3UZ09 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1rlQ3UZ09 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1rlQ3UZ09 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1rlQ3UZ09 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1rlQ3UZ09 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1rlQ3UZ09 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1rlQ3UZ09 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1rlQ3UZ09 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1rlQ3UZ09 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1rlQ3UZ09 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1rlQ3UZ09 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1rlQ3UZ09 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1rlQ3UZ09 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1rlQ3UZ09 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1rlQ3UZ09 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1rlQ3UZ09 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1rlQ3UZ09 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms