Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C87499Q3UX49 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C87499Q3UX49 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C87499Q3UX49 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C87499Q3UX49 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C87499Q3UX49 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C87499Q3UX49 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C87499Q3UX49 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C87499Q3UX49 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C87499Q3UX49 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C87499Q3UX49 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C87499Q3UX49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C87499Q3UX49 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C87499Q3UX49 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C87499Q3UX49 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C87499Q3UX49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C87499Q3UX49 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C87499Q3UX49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C87499Q3UX49 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C87499Q3UX49 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C87499Q3UX49 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C87499Q3UX49 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C87499Q3UX49 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
C87499Q3UX49 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C87499Q3UX49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C87499Q3UX49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C87499Q3UX49 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C87499Q3UX49 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C87499Q3UX49 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
C87499Q3UX49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C87499Q3UX49 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C87499Q3UX49 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C87499Q3UX49 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C87499Q3UX49 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C87499Q3UX49 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C87499Q3UX49 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C87499Q3UX49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C87499Q3UX49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C87499Q3UX49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C87499Q3UX49 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C87499Q3UX49 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C87499Q3UX49 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
C87499Q3UX49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C87499Q3UX49 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C87499Q3UX49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C87499Q3UX49 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C87499Q3UX49 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C87499Q3UX49 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
C87499Q3UX49 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C87499Q3UX49 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C87499Q3UX49 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C87499Q3UX49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C87499Q3UX49 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C87499Q3UX49 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C87499Q3UX49 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms