Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ankrd13cQ3UX43 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ankrd13cQ3UX43 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ankrd13cQ3UX43 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ankrd13cQ3UX43 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ankrd13cQ3UX43 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ankrd13cQ3UX43 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ankrd13cQ3UX43 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ankrd13cQ3UX43 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ankrd13cQ3UX43 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ankrd13cQ3UX43 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ankrd13cQ3UX43 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ankrd13cQ3UX43 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ankrd13cQ3UX43 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ankrd13cQ3UX43 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ankrd13cQ3UX43 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ankrd13cQ3UX43 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Ankrd13cQ3UX43 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ankrd13cQ3UX43 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ankrd13cQ3UX43 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ankrd13cQ3UX43 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ankrd13cQ3UX43 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ankrd13cQ3UX43 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ankrd13cQ3UX43 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ankrd13cQ3UX43 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ankrd13cQ3UX43 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ankrd13cQ3UX43 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Ankrd13cQ3UX43 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ankrd13cQ3UX43 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ankrd13cQ3UX43 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ankrd13cQ3UX43 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ankrd13cQ3UX43 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ankrd13cQ3UX43 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ankrd13cQ3UX43 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ankrd13cQ3UX43 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ankrd13cQ3UX43 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ankrd13cQ3UX43 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ankrd13cQ3UX43 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ankrd13cQ3UX43 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ankrd13cQ3UX43 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ankrd13cQ3UX43 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ankrd13cQ3UX43 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ankrd13cQ3UX43 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ankrd13cQ3UX43 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ankrd13cQ3UX43 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ankrd13cQ3UX43 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ankrd13cQ3UX43 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ankrd13cQ3UX43 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ankrd13cQ3UX43 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ankrd13cQ3UX43 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ankrd13cQ3UX43 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ankrd13cQ3UX43 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ankrd13cQ3UX43 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ankrd13cQ3UX43 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ankrd13cQ3UX43 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ankrd13cQ3UX43 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ankrd13cQ3UX43 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ankrd13cQ3UX43 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ankrd13cQ3UX43 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ankrd13cQ3UX43 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ankrd13cQ3UX43 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms