Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pfdn4Q3UWL8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pfdn4Q3UWL8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pfdn4Q3UWL8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pfdn4Q3UWL8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pfdn4Q3UWL8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pfdn4Q3UWL8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pfdn4Q3UWL8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pfdn4Q3UWL8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfdn4Q3UWL8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pfdn4Q3UWL8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pfdn4Q3UWL8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfdn4Q3UWL8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pfdn4Q3UWL8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pfdn4Q3UWL8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pfdn4Q3UWL8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfdn4Q3UWL8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfdn4Q3UWL8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfdn4Q3UWL8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pfdn4Q3UWL8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfdn4Q3UWL8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms