Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A530084C06RikQ3UTW2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A530084C06RikQ3UTW2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A530084C06RikQ3UTW2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530084C06RikQ3UTW2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms