Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubtfl1Q3USZ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubtfl1Q3USZ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubtfl1Q3USZ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubtfl1Q3USZ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubtfl1Q3USZ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubtfl1Q3USZ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubtfl1Q3USZ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ubtfl1Q3USZ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubtfl1Q3USZ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubtfl1Q3USZ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubtfl1Q3USZ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubtfl1Q3USZ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubtfl1Q3USZ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubtfl1Q3USZ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubtfl1Q3USZ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubtfl1Q3USZ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubtfl1Q3USZ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubtfl1Q3USZ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubtfl1Q3USZ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubtfl1Q3USZ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubtfl1Q3USZ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubtfl1Q3USZ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubtfl1Q3USZ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubtfl1Q3USZ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubtfl1Q3USZ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubtfl1Q3USZ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubtfl1Q3USZ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubtfl1Q3USZ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms