Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r12cQ3UMT1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r12cQ3UMT1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r12cQ3UMT1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r12cQ3UMT1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppp1r12cQ3UMT1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp1r12cQ3UMT1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r12cQ3UMT1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r12cQ3UMT1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r12cQ3UMT1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r12cQ3UMT1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r12cQ3UMT1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r12cQ3UMT1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ppp1r12cQ3UMT1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r12cQ3UMT1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r12cQ3UMT1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppp1r12cQ3UMT1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppp1r12cQ3UMT1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppp1r12cQ3UMT1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r12cQ3UMT1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r12cQ3UMT1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r12cQ3UMT1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppp1r12cQ3UMT1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp1r12cQ3UMT1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp1r12cQ3UMT1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp1r12cQ3UMT1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms