Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Eif3j1Q3UGC7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Eif3j1Q3UGC7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Eif3j1Q3UGC7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Eif3j1Q3UGC7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif3j1Q3UGC7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif3j1Q3UGC7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif3j1Q3UGC7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Eif3j1Q3UGC7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Eif3j1Q3UGC7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Eif3j1Q3UGC7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Eif3j1Q3UGC7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Eif3j1Q3UGC7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Eif3j1Q3UGC7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Eif3j1Q3UGC7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Eif3j1Q3UGC7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Eif3j1Q3UGC7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Eif3j1Q3UGC7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3j1Q3UGC7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3j1Q3UGC7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3j1Q3UGC7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Eif3j1Q3UGC7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Eif3j1Q3UGC7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Eif3j1Q3UGC7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Eif3j1Q3UGC7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Eif3j1Q3UGC7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Eif3j1Q3UGC7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Eif3j1Q3UGC7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif3j1Q3UGC7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3j1Q3UGC7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3j1Q3UGC7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3j1Q3UGC7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Eif3j1Q3UGC7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Eif3j1Q3UGC7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Eif3j1Q3UGC7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Eif3j1Q3UGC7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Eif3j1Q3UGC7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif3j1Q3UGC7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Eif3j1Q3UGC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Eif3j1Q3UGC7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms