Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Wdr41Q3UDP0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Wdr41Q3UDP0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Wdr41Q3UDP0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Wdr41Q3UDP0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Wdr41Q3UDP0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Wdr41Q3UDP0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Wdr41Q3UDP0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Wdr41Q3UDP0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr41Q3UDP0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr41Q3UDP0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Wdr41Q3UDP0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Wdr41Q3UDP0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Wdr41Q3UDP0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Wdr41Q3UDP0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Wdr41Q3UDP0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Wdr41Q3UDP0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Wdr41Q3UDP0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr41Q3UDP0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr41Q3UDP0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr41Q3UDP0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr41Q3UDP0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr41Q3UDP0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Wdr41Q3UDP0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Wdr41Q3UDP0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Wdr41Q3UDP0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Wdr41Q3UDP0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Wdr41Q3UDP0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Wdr41Q3UDP0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Wdr41Q3UDP0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Wdr41Q3UDP0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Wdr41Q3UDP0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Wdr41Q3UDP0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Wdr41Q3UDP0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Wdr41Q3UDP0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Wdr41Q3UDP0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Wdr41Q3UDP0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Wdr41Q3UDP0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Wdr41Q3UDP0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Wdr41Q3UDP0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Wdr41Q3UDP0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Wdr41Q3UDP0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Wdr41Q3UDP0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Wdr41Q3UDP0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Wdr41Q3UDP0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr41Q3UDP0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr41Q3UDP0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr41Q3UDP0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr41Q3UDP0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Wdr41Q3UDP0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr41Q3UDP0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr41Q3UDP0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr41Q3UDP0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr41Q3UDP0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms