Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4S0

Pank2, Pantothenate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank2Q3U4S0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pank2Q3U4S0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pank2Q3U4S0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pank2Q3U4S0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pank2Q3U4S0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pank2Q3U4S0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pank2Q3U4S0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pank2Q3U4S0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pank2Q3U4S0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pank2Q3U4S0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pank2Q3U4S0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pank2Q3U4S0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pank2Q3U4S0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pank2Q3U4S0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pank2Q3U4S0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pank2Q3U4S0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pank2Q3U4S0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pank2Q3U4S0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pank2Q3U4S0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pank2Q3U4S0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pank2Q3U4S0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pank2Q3U4S0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pank2Q3U4S0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pank2Q3U4S0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pank2Q3U4S0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pank2Q3U4S0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pank2Q3U4S0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pank2Q3U4S0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pank2Q3U4S0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pank2Q3U4S0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pank2Q3U4S0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pank2Q3U4S0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pank2Q3U4S0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pank2Q3U4S0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pank2Q3U4S0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pank2Q3U4S0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pank2Q3U4S0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pank2Q3U4S0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pank2Q3U4S0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pank2Q3U4S0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pank2Q3U4S0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pank2Q3U4S0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pank2Q3U4S0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms