Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm4dQ3U2K5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4dQ3U2K5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4dQ3U2K5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4dQ3U2K5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4dQ3U2K5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4dQ3U2K5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4dQ3U2K5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4dQ3U2K5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4dQ3U2K5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4dQ3U2K5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4dQ3U2K5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4dQ3U2K5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4dQ3U2K5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4dQ3U2K5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4dQ3U2K5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms