Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf149Q3U2C5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf149Q3U2C5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf149Q3U2C5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf149Q3U2C5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf149Q3U2C5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf149Q3U2C5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf149Q3U2C5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf149Q3U2C5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf149Q3U2C5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf149Q3U2C5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf149Q3U2C5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf149Q3U2C5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf149Q3U2C5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf149Q3U2C5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf149Q3U2C5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf149Q3U2C5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf149Q3U2C5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf149Q3U2C5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf149Q3U2C5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf149Q3U2C5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf149Q3U2C5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf149Q3U2C5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms