Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TraddQ3U0V2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TraddQ3U0V2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TraddQ3U0V2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TraddQ3U0V2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TraddQ3U0V2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TraddQ3U0V2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TraddQ3U0V2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TraddQ3U0V2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TraddQ3U0V2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TraddQ3U0V2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TraddQ3U0V2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TraddQ3U0V2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TraddQ3U0V2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TraddQ3U0V2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TraddQ3U0V2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TraddQ3U0V2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TraddQ3U0V2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TraddQ3U0V2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TraddQ3U0V2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TraddQ3U0V2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TraddQ3U0V2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TraddQ3U0V2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TraddQ3U0V2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TraddQ3U0V2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TraddQ3U0V2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TraddQ3U0V2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TraddQ3U0V2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms