Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KhsrpQ3U0V1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KhsrpQ3U0V1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KhsrpQ3U0V1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KhsrpQ3U0V1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KhsrpQ3U0V1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KhsrpQ3U0V1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KhsrpQ3U0V1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KhsrpQ3U0V1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KhsrpQ3U0V1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KhsrpQ3U0V1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KhsrpQ3U0V1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KhsrpQ3U0V1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KhsrpQ3U0V1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KhsrpQ3U0V1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KhsrpQ3U0V1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KhsrpQ3U0V1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KhsrpQ3U0V1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KhsrpQ3U0V1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KhsrpQ3U0V1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KhsrpQ3U0V1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KhsrpQ3U0V1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KhsrpQ3U0V1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KhsrpQ3U0V1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KhsrpQ3U0V1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KhsrpQ3U0V1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KhsrpQ3U0V1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KhsrpQ3U0V1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KhsrpQ3U0V1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KhsrpQ3U0V1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KhsrpQ3U0V1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms