Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TchpQ3TVW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TchpQ3TVW5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TchpQ3TVW5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TchpQ3TVW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TchpQ3TVW5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TchpQ3TVW5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TchpQ3TVW5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TchpQ3TVW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TchpQ3TVW5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TchpQ3TVW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TchpQ3TVW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TchpQ3TVW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TchpQ3TVW5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms