Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp39Q3TIX9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp39Q3TIX9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp39Q3TIX9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp39Q3TIX9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp39Q3TIX9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp39Q3TIX9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp39Q3TIX9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp39Q3TIX9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp39Q3TIX9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp39Q3TIX9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp39Q3TIX9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp39Q3TIX9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp39Q3TIX9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp39Q3TIX9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp39Q3TIX9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp39Q3TIX9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp39Q3TIX9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp39Q3TIX9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp39Q3TIX9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp39Q3TIX9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp39Q3TIX9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp39Q3TIX9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp39Q3TIX9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms