Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem104Q3TB48 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem104Q3TB48 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem104Q3TB48 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem104Q3TB48 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem104Q3TB48 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem104Q3TB48 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem104Q3TB48 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem104Q3TB48 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem104Q3TB48 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem104Q3TB48 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem104Q3TB48 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem104Q3TB48 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem104Q3TB48 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem104Q3TB48 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms