Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hddc2Q3SXD3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hddc2Q3SXD3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hddc2Q3SXD3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hddc2Q3SXD3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hddc2Q3SXD3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hddc2Q3SXD3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hddc2Q3SXD3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hddc2Q3SXD3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hddc2Q3SXD3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hddc2Q3SXD3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hddc2Q3SXD3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hddc2Q3SXD3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hddc2Q3SXD3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hddc2Q3SXD3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms