Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms