Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col19a1Q0VF58 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Col19a1Q0VF58 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col19a1Q0VF58 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col19a1Q0VF58 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col19a1Q0VF58 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col19a1Q0VF58 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col19a1Q0VF58 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col19a1Q0VF58 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col19a1Q0VF58 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Col19a1Q0VF58 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col19a1Q0VF58 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col19a1Q0VF58 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Col19a1Q0VF58 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col19a1Q0VF58 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col19a1Q0VF58 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col19a1Q0VF58 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col19a1Q0VF58 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col19a1Q0VF58 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col19a1Q0VF58 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col19a1Q0VF58 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col19a1Q0VF58 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col19a1Q0VF58 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col19a1Q0VF58 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col19a1Q0VF58 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col19a1Q0VF58 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col19a1Q0VF58 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col19a1Q0VF58 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col19a1Q0VF58 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col19a1Q0VF58 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col19a1Q0VF58 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col19a1Q0VF58 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col19a1Q0VF58 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col19a1Q0VF58 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col19a1Q0VF58 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Col19a1Q0VF58 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col19a1Q0VF58 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col19a1Q0VF58 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col19a1Q0VF58 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col19a1Q0VF58 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col19a1Q0VF58 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Col19a1Q0VF58 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col19a1Q0VF58 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col19a1Q0VF58 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col19a1Q0VF58 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Col19a1Q0VF58 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col19a1Q0VF58 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col19a1Q0VF58 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col19a1Q0VF58 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col19a1Q0VF58 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col19a1Q0VF58 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col19a1Q0VF58 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col19a1Q0VF58 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col19a1Q0VF58 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col19a1Q0VF58 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 679.9 ms