Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc138Q0VF22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc138Q0VF22 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc138Q0VF22 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc138Q0VF22 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc138Q0VF22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc138Q0VF22 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc138Q0VF22 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc138Q0VF22 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc138Q0VF22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc138Q0VF22 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc138Q0VF22 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc138Q0VF22 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc138Q0VF22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc138Q0VF22 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc138Q0VF22 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc138Q0VF22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc138Q0VF22 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc138Q0VF22 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc138Q0VF22 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc138Q0VF22 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc138Q0VF22 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc138Q0VF22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc138Q0VF22 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc138Q0VF22 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc138Q0VF22 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc138Q0VF22 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc138Q0VF22 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms