Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBN2

Dsel, Dermatan-sulfate epimerase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DselQ0VBN2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DselQ0VBN2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DselQ0VBN2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DselQ0VBN2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DselQ0VBN2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DselQ0VBN2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DselQ0VBN2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DselQ0VBN2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DselQ0VBN2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DselQ0VBN2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DselQ0VBN2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DselQ0VBN2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DselQ0VBN2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DselQ0VBN2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DselQ0VBN2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DselQ0VBN2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DselQ0VBN2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DselQ0VBN2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DselQ0VBN2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DselQ0VBN2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DselQ0VBN2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DselQ0VBN2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DselQ0VBN2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DselQ0VBN2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DselQ0VBN2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DselQ0VBN2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DselQ0VBN2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DselQ0VBN2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DselQ0VBN2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DselQ0VBN2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DselQ0VBN2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DselQ0VBN2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DselQ0VBN2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DselQ0VBN2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DselQ0VBN2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DselQ0VBN2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DselQ0VBN2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DselQ0VBN2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DselQ0VBN2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DselQ0VBN2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DselQ0VBN2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DselQ0VBN2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms