Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cntnap5bQ0V8T8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cntnap5bQ0V8T8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cntnap5bQ0V8T8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cntnap5bQ0V8T8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cntnap5bQ0V8T8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cntnap5bQ0V8T8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cntnap5bQ0V8T8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cntnap5bQ0V8T8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cntnap5bQ0V8T8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cntnap5bQ0V8T8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cntnap5bQ0V8T8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cntnap5bQ0V8T8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cntnap5bQ0V8T8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cntnap5bQ0V8T8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cntnap5bQ0V8T8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cntnap5bQ0V8T8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cntnap5bQ0V8T8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cntnap5bQ0V8T8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cntnap5bQ0V8T8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cntnap5bQ0V8T8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cntnap5bQ0V8T8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cntnap5bQ0V8T8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cntnap5bQ0V8T8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cntnap5bQ0V8T8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cntnap5bQ0V8T8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cntnap5bQ0V8T8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cntnap5bQ0V8T8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cntnap5bQ0V8T8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cntnap5bQ0V8T8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cntnap5bQ0V8T8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cntnap5bQ0V8T8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cntnap5bQ0V8T8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cntnap5bQ0V8T8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cntnap5bQ0V8T8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cntnap5bQ0V8T8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cntnap5bQ0V8T8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cntnap5bQ0V8T8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cntnap5bQ0V8T8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cntnap5bQ0V8T8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cntnap5bQ0V8T8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cntnap5bQ0V8T8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cntnap5bQ0V8T8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cntnap5bQ0V8T8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cntnap5bQ0V8T8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cntnap5bQ0V8T8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cntnap5bQ0V8T8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cntnap5bQ0V8T8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cntnap5bQ0V8T8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cntnap5bQ0V8T8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cntnap5bQ0V8T8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cntnap5bQ0V8T8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cntnap5bQ0V8T8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cntnap5bQ0V8T8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cntnap5bQ0V8T8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms