Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TrioQ0KL02 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TrioQ0KL02 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TrioQ0KL02 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TrioQ0KL02 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TrioQ0KL02 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TrioQ0KL02 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TrioQ0KL02 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TrioQ0KL02 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TrioQ0KL02 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TrioQ0KL02 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TrioQ0KL02 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TrioQ0KL02 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TrioQ0KL02 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TrioQ0KL02 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TrioQ0KL02 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TrioQ0KL02 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TrioQ0KL02 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TrioQ0KL02 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TrioQ0KL02 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TrioQ0KL02 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TrioQ0KL02 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TrioQ0KL02 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TrioQ0KL02 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TrioQ0KL02 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TrioQ0KL02 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TrioQ0KL02 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TrioQ0KL02 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TrioQ0KL02 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrioQ0KL02 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrioQ0KL02 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TrioQ0KL02 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TrioQ0KL02 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrioQ0KL02 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TrioQ0KL02 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TrioQ0KL02 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TrioQ0KL02 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TrioQ0KL02 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TrioQ0KL02 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TrioQ0KL02 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TrioQ0KL02 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TrioQ0KL02 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TrioQ0KL02 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TrioQ0KL02 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms