Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NrepQ07475 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NrepQ07475 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NrepQ07475 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NrepQ07475 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NrepQ07475 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NrepQ07475 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NrepQ07475 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NrepQ07475 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NrepQ07475 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NrepQ07475 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NrepQ07475 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NrepQ07475 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NrepQ07475 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms