Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl7Q03366 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl7Q03366 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl7Q03366 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl7Q03366 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl7Q03366 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccl7Q03366 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl7Q03366 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl7Q03366 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl7Q03366 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl7Q03366 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl7Q03366 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl7Q03366 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl7Q03366 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl7Q03366 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl7Q03366 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccl7Q03366 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccl7Q03366 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccl7Q03366 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccl7Q03366 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccl7Q03366 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccl7Q03366 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccl7Q03366 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccl7Q03366 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccl7Q03366 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccl7Q03366 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccl7Q03366 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccl7Q03366 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccl7Q03366 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccl7Q03366 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccl7Q03366 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccl7Q03366 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccl7Q03366 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccl7Q03366 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccl7Q03366 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccl7Q03366 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms