Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mark3Q03141 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mark3Q03141 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mark3Q03141 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mark3Q03141 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mark3Q03141 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mark3Q03141 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mark3Q03141 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mark3Q03141 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Mark3Q03141 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Mark3Q03141 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Mark3Q03141 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Mark3Q03141 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mark3Q03141 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mark3Q03141 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mark3Q03141 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mark3Q03141 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mark3Q03141 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mark3Q03141 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mark3Q03141 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mark3Q03141 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mark3Q03141 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mark3Q03141 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mark3Q03141 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mark3Q03141 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mark3Q03141 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mark3Q03141 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mark3Q03141 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mark3Q03141 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Mark3Q03141 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mark3Q03141 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mark3Q03141 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mark3Q03141 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mark3Q03141 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mark3Q03141 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mark3Q03141 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mark3Q03141 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mark3Q03141 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Mark3Q03141 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mark3Q03141 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mark3Q03141 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Mark3Q03141 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mark3Q03141 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mark3Q03141 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mark3Q03141 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mark3Q03141 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mark3Q03141 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mark3Q03141 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mark3Q03141 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mark3Q03141 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mark3Q03141 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mark3Q03141 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mark3Q03141 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mark3Q03141 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mark3Q03141 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mark3Q03141 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mark3Q03141 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mark3Q03141 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mark3Q03141 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mark3Q03141 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mark3Q03141 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mark3Q03141 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mark3Q03141 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mark3Q03141 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mark3Q03141 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms