Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col6a2Q02788 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col6a2Q02788 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col6a2Q02788 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col6a2Q02788 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col6a2Q02788 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Col6a2Q02788 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col6a2Q02788 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col6a2Q02788 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col6a2Q02788 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col6a2Q02788 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col6a2Q02788 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col6a2Q02788 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col6a2Q02788 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col6a2Q02788 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col6a2Q02788 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col6a2Q02788 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col6a2Q02788 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Col6a2Q02788 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col6a2Q02788 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col6a2Q02788 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col6a2Q02788 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col6a2Q02788 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col6a2Q02788 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col6a2Q02788 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col6a2Q02788 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col6a2Q02788 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms