Protein–RNA interactions for Protein: Q02526

Zfp41, Zinc finger protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp41Q02526 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp41Q02526 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp41Q02526 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp41Q02526 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp41Q02526 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp41Q02526 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp41Q02526 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp41Q02526 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp41Q02526 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp41Q02526 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp41Q02526 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp41Q02526 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp41Q02526 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp41Q02526 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp41Q02526 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp41Q02526 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp41Q02526 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp41Q02526 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp41Q02526 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp41Q02526 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp41Q02526 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp41Q02526 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp41Q02526 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp41Q02526 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms